Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHK1Q9NYA1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPHK1Q9NYA1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPHK1Q9NYA1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms