Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms