Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTN4Q9NQC3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RTN4Q9NQC3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN4Q9NQC3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms