Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASS4Q9NQ75 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASS4Q9NQ75 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASS4Q9NQ75 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms