Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCLK3Q9C098 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCLK3Q9C098 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms