Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM3Q9BZL3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMIM3Q9BZL3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM3Q9BZL3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.8 ms