Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UPF3BQ9BZI7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPF3BQ9BZI7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF3BQ9BZI7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms