Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNM3Q9BZ71 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNM3Q9BZ71 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITPNM3Q9BZ71 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms