Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNHG12Q9BXW3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms