Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERC2P3Q9BVR0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC2P3Q9BVR0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms