Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MRI1Q9BV20 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRI1Q9BV20 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms