Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RBM42Q9BTD8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RBM42Q9BTD8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RBM42Q9BTD8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RBM42Q9BTD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms