Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PAAF1Q9BRP4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PAAF1Q9BRP4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms