Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUDCD1Q96RS6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUDCD1Q96RS6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms