Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNGAP1Q96PV0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms