Protein–RNA interactions for Protein: Q96KV7

WDR90, WD repeat-containing protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR90Q96KV7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
WDR90Q96KV7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR90Q96KV7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR90Q96KV7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms