Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC16BQ96JE7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC16BQ96JE7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC16BQ96JE7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms