Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
COG3Q96JB2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
COG3Q96JB2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
COG3Q96JB2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms