Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN7L3BQ96GX2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATXN7L3BQ96GX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms