Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX27Q96GQ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX27Q96GQ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX27Q96GQ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX27Q96GQ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX27Q96GQ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX27Q96GQ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms