Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY54

PPM1E, Protein phosphatase 1E, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1EQ8WY54 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1EQ8WY54 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPM1EQ8WY54 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1EQ8WY54 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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