Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNE4Q8N205 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNE4Q8N205 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNE4Q8N205 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms