Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM139Q8IV31 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM139Q8IV31 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM139Q8IV31 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms