Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNI2Q6ZMN8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNI2Q6ZMN8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNI2Q6ZMN8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms