Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRSAM1Q6UWE0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRSAM1Q6UWE0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms