Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF549Q6P9A3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF549Q6P9A3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF549Q6P9A3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms