Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LCN8Q6JVE9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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LCN8Q6JVE9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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LCN8Q6JVE9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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LCN8Q6JVE9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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LCN8Q6JVE9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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LCN8Q6JVE9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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LCN8Q6JVE9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN8Q6JVE9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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LCN8Q6JVE9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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LCN8Q6JVE9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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LCN8Q6JVE9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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LCN8Q6JVE9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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LCN8Q6JVE9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms