Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CARD17Q5XLA6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CARD17Q5XLA6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms