Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYSMD4Q5XG99 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYSMD4Q5XG99 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYSMD4Q5XG99 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms