Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC181Q5TID7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC181Q5TID7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms