Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRFIP1Q32MZ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms