Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIF1AQ16665 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIF1AQ16665 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
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