Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
EEA1Q15075 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
EEA1Q15075 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
EEA1Q15075 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 367.8 ms