Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF9Q13886 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF9Q13886 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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