Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	GAL4	YPL248C	2646 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	YEL067C	YEL067C	588 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	YGR022C	YGR022C	330 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	YHL049C	YHL049C	816 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	SLD7	YOR060C	774 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	TGS1	YPL157W	948 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	LCP5	YER127W	1074 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	NAG1	YGR031C-A	492 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	YGR122W	YGR122W	1209 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	NIT2	YJL126W	924 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	MNN11	YJL183W	1269 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	CPR6	YLR216C	1116 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	MRI1	YPR118W	1236 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	PZF1	YPR186C	1290 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	RTT106	YNL206C	1368 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	MPS3	YJL019W	2049 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	AVT3	YKL146W	2079 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	ALG2	YGL065C	1512 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	MSS116	YDR194C	1995 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	CBP4	YGR174C	513 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	SKI6	YGR195W	741 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	MRPL22	YNL177C	930 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	DAL82	YNL314W	768 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	GAL10	YBR019C	2100 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	ETR1	YBR026C	1143 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	GPR1	YDL035C	2886 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	PCA1	YBR295W	3651 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	GIR2	YDR152W	798 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	YMR245W	YMR245W	621 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	SHP1	YBL058W	1272 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	THI20	YOL055C	1656 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	HXT7	YDR342C	1713 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	HXT6	YDR343C	1713 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	VHC1	YBR235W	3363 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	PAN1	YIR006C	4443 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	ABF1	YKL112W	2196 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	MSE1	YOL033W	1611 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	IWR1	YDL115C	1062 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	CBT1	YKL208W	816 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	YNR075C-A	YNR075C-A	93 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VIK1	Q12045	GCN20	YFR009W	2259 nt		4.84	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	TFG1	YGR186W	2208 nt		4.84	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	HOT1	YMR172W	2160 nt		4.84	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	FAA4	YMR246W	2085 nt		4.84	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	ICE2	YIL090W	1476 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	COQ6	YGR255C	1440 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	KAP114	YGL241W	3015 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	RSM10	YDR041W	612 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	TRS23	YDR246W	660 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	YDR417C	YDR417C	372 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	YGR016W	YGR016W	573 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	KTI12	YKL110C	942 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	SEN34	YAR008W	828 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	SCW10	YMR305C	1170 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	HIR2	YOR038C	2628 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	MDR1	YGR100W	2853 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	ADE4	YMR300C	1533 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	CLA4	YNL298W	2529 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	THP1	YOL072W	1368 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	YJR124C	YJR124C	1347 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	SUR2	YDR297W	1050 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	TRX2	YGR209C	315 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	FMP33	YJL161W	543 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	YJR115W	YJR115W	510 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	FUI1	YBL042C	1920 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	BOP2	YLR267W	1713 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	CNM67	YNL225C	1746 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	LYS5	YGL154C	819 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	HPM1	YIL110W	1134 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	PGU1	YJR153W	1086 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	MAP2	YBL091C	1266 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	SMA1	YPL027W	738 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	snR19	snR19	568 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	KTR3	YBR205W	1215 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	PHO8	YDR481C	1701 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	GLE2	YER107C	1098 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	CSM2	YIL132C	642 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	CBF1	YJR060W	1056 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	MRP17	YKL003C	396 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	YPL113C	YPL113C	1191 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	HSP82	YPL240C	2130 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	URA7	YBL039C	1740 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	HRK1	YOR267C	2280 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	YDL119C	YDL119C	924 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	CNL1	YDR357C	369 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	DCN1	YLR128W	810 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	RPL3	YOR063W	1164 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	CAR1	YPL111W	1002 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	UIP4	YPL186C	915 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	RFT1	YBL020W	1725 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	ADE3	YGR204W	2841 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	LEU1	YGL009C	2340 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	YPL260W	YPL260W	1656 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	TDH3	YGR192C	999 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	YHR127W	YHR127W	732 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	ECM1	YAL059W	639 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	TLG2	YOL018C	1194 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VIK1	Q12045	RER2	YBR002C	861 nt		4.78	□□□□□ -1.64

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