Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SLFN5Q08AF3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLFN5Q08AF3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLFN5Q08AF3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms