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Protein–RNA interactions for Protein: Q03691
ROT1, Protein ROT1, yeast
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256 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ROT1
Q03691
AGP2
YBR132C
1791 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
GIP2
YER054C
1647 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
ICL2
YPR006C
1728 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
UGX2
YDL169C
672 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
BMH1
YER177W
804 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
HGH1
YGR187C
1185 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
EGD2
YHR193C
525 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
BCY1
YIL033C
1251 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
MRT4
YKL009W
711 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
YKL202W
YKL202W
582 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
YNL143C
YNL143C
393 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
MED8
YBR193C
672 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
MRPS5
YBR251W
924 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
NOP7
YGR103W
1818 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
ALG1
YBR110W
1350 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
TOS2
YGR221C
1869 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
TPO3
YPR156C
1869 nt
5.75
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
MUP3
YHL036W
1641 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
MNN10
YDR245W
1182 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
YGL214W
YGL214W
486 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
CMC1
YKL137W
336 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
SEC72
YLR292C
582 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
YOR292C
YOR292C
930 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
ISN1
YOR155C
1353 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
ATG4
YNL223W
1485 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
SLI1
YGR212W
1407 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
HSM3
YBR272C
1443 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
CUS1
YMR240C
1311 nt
5.74
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
KKQ8
YKL168C
2175 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
YDL124W
YDL124W
939 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
CAF16
YFL028C
870 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
BTN2
YGR142W
1233 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
MRPL49
YJL096W
486 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
ASK1
YKL052C
879 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
PXL1
YKR090W
2121 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
MMM1
YLL006W
1281 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
YLR326W
YLR326W
723 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
YIM2
YMR151W
438 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
RPB8
YOR224C
441 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
LDH1
YBR204C
1128 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
PRP2
YNR011C
2631 nt
5.73
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
IME2
YJL106W
1938 nt
5.72
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
MSS2
YDL107W
1056 nt
5.72
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
YIL089W
YIL089W
618 nt
5.72
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
CPR7
YJR032W
1182 nt
5.72
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
GPN3
YLR243W
819 nt
5.72
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
NIT3
YLR351C
876 nt
5.72
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
COX11
YPL132W
903 nt
5.72
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
PAP2
YOL115W
1755 nt
5.72
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
ORC5
YNL261W
1440 nt
5.72
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
TFG1
YGR186W
2208 nt
5.71
□□□□□ -1.49
ROT1
Q03691
GPB2
YAL056W
2643 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
PRD1
YCL057W
2139 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
AFG1
YEL052W
1530 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
CPR1
YDR155C
489 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
RPT3
YDR394W
1287 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
BGL2
YGR282C
942 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
IST3
YIR005W
447 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
PSF2
YJL072C
642 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
CBF1
YJR060W
1056 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
DAN1
YJR150C
897 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
YLR363W-A
YLR363W-A
258 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
ANT1
YPR128C
987 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
ATG12
YBR217W
561 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
NMD5
YJR132W
3147 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
MCM3
YEL032W
2916 nt
5.71
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
MAD3
YJL013C
1548 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
DEF1
YKL054C
2217 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
HTB1
YDR224C
396 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
SNM1
YDR478W
597 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
YGL230C
YGL230C
444 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
SYF2
YGR129W
648 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
ERV29
YGR284C
933 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
RPS31
YLR167W
459 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
MRPS12
YNR036C
462 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
UBC11
YOR339C
471 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
STE50
YCL032W
1041 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
GRX1
YCL035C
333 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
COQ6
YGR255C
1440 nt
5.7
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
SLX5
YDL013W
1860 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
MAL13
YGR288W
1422 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
MTC1
YJL123C
1437 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
YDL172C
YDL172C
480 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
MHR1
YDR296W
681 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
PRE1
YER012W
597 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
ICS3
YJL077C
396 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
YMR144W
YMR144W
1029 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
MRPS17
YMR188C
714 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
INP1
YMR204C
1263 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
YOL118C
YOL118C
309 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
GYP8
YFL027C
1494 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
GAA1
YLR088W
1845 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
HST1
YOL068C
1512 nt
5.69
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
SLD2
YKL108W
1362 nt
5.68
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
MLF3
YNL074C
1359 nt
5.68
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
ASN2
YGR124W
1719 nt
5.68
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
PHO3
YBR092C
1404 nt
5.68
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
ATR1
YML116W
1629 nt
5.68
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
YDL162C
YDL162C
357 nt
5.68
□□□□□ -1.5
ROT1
Q03691
YDR290W
YDR290W
330 nt
5.68
□□□□□ -1.5
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