Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX2Q02962 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX2Q02962 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms