Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCEQ02156 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRKCEQ02156 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms