Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX1Q01196 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms