Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC1P78364 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC1P78364 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC1P78364 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC1P78364 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC1P78364 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC1P78364 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC1P78364 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC1P78364 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC1P78364 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHC1P78364 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHC1P78364 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHC1P78364 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHC1P78364 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHC1P78364 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHC1P78364 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHC1P78364 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHC1P78364 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHC1P78364 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHC1P78364 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHC1P78364 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHC1P78364 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHC1P78364 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHC1P78364 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHC1P78364 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHC1P78364 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHC1P78364 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHC1P78364 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHC1P78364 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHC1P78364 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHC1P78364 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHC1P78364 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHC1P78364 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHC1P78364 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHC1P78364 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHC1P78364 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHC1P78364 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHC1P78364 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHC1P78364 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHC1P78364 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHC1P78364 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHC1P78364 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHC1P78364 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHC1P78364 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHC1P78364 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHC1P78364 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHC1P78364 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHC1P78364 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHC1P78364 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHC1P78364 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHC1P78364 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHC1P78364 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHC1P78364 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHC1P78364 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHC1P78364 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PHC1P78364 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHC1P78364 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHC1P78364 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHC1P78364 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHC1P78364 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHC1P78364 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms