Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP54P61011 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP54P61011 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRP54P61011 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP54P61011 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP54P61011 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP54P61011 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP54P61011 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP54P61011 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP54P61011 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP54P61011 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRP54P61011 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP54P61011 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP54P61011 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP54P61011 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP54P61011 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRP54P61011 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP54P61011 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP54P61011 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP54P61011 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP54P61011 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP54P61011 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRP54P61011 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRP54P61011 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRP54P61011 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRP54P61011 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP54P61011 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP54P61011 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP54P61011 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP54P61011 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRP54P61011 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP54P61011 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP54P61011 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP54P61011 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP54P61011 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP54P61011 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP54P61011 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP54P61011 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP54P61011 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP54P61011 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP54P61011 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP54P61011 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP54P61011 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP54P61011 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP54P61011 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP54P61011 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP54P61011 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP54P61011 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP54P61011 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP54P61011 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP54P61011 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP54P61011 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP54P61011 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP54P61011 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP54P61011 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP54P61011 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP54P61011 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP54P61011 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP54P61011 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP54P61011 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP54P61011 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP54P61011 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP54P61011 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP54P61011 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP54P61011 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP54P61011 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP54P61011 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP54P61011 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRP54P61011 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRP54P61011 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRP54P61011 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SRP54P61011 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP54P61011 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP54P61011 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP54P61011 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRP54P61011 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms