Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB15P59190 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB15P59190 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB15P59190 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB15P59190 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB15P59190 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB15P59190 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB15P59190 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB15P59190 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB15P59190 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB15P59190 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB15P59190 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB15P59190 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB15P59190 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB15P59190 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB15P59190 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB15P59190 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB15P59190 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB15P59190 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB15P59190 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB15P59190 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB15P59190 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB15P59190 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB15P59190 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB15P59190 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB15P59190 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB15P59190 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB15P59190 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB15P59190 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB15P59190 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB15P59190 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB15P59190 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB15P59190 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB15P59190 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB15P59190 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB15P59190 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB15P59190 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB15P59190 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB15P59190 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB15P59190 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB15P59190 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB15P59190 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB15P59190 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB15P59190 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB15P59190 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB15P59190 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB15P59190 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB15P59190 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB15P59190 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB15P59190 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB15P59190 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB15P59190 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB15P59190 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms