Protein–RNA interactions for Protein: P55957

BID, BH3-interacting domain death agonist, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIDP55957 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BIDP55957 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BIDP55957 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIDP55957 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIDP55957 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIDP55957 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIDP55957 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIDP55957 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BIDP55957 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIDP55957 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIDP55957 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIDP55957 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BIDP55957 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BIDP55957 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BIDP55957 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BIDP55957 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BIDP55957 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIDP55957 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIDP55957 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIDP55957 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIDP55957 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIDP55957 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIDP55957 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIDP55957 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIDP55957 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIDP55957 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BIDP55957 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BIDP55957 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BIDP55957 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BIDP55957 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BIDP55957 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BIDP55957 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIDP55957 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIDP55957 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIDP55957 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIDP55957 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIDP55957 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIDP55957 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIDP55957 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIDP55957 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIDP55957 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIDP55957 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIDP55957 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIDP55957 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIDP55957 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIDP55957 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIDP55957 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIDP55957 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIDP55957 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIDP55957 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIDP55957 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIDP55957 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIDP55957 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIDP55957 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIDP55957 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIDP55957 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIDP55957 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIDP55957 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIDP55957 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIDP55957 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIDP55957 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BIDP55957 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BIDP55957 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BIDP55957 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BIDP55957 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms