Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RCAN1P53805 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RCAN1P53805 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms