Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC9A3P48764 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A3P48764 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms