Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
RANGAP1P46060 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RANGAP1P46060 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RANGAP1P46060 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms