Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP2P42575 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP2P42575 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP2P42575 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP2P42575 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP2P42575 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP2P42575 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP2P42575 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP2P42575 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP2P42575 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP2P42575 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP2P42575 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP2P42575 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP2P42575 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP2P42575 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP2P42575 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP2P42575 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP2P42575 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP2P42575 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP2P42575 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP2P42575 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP2P42575 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP2P42575 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP2P42575 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP2P42575 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP2P42575 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP2P42575 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP2P42575 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP2P42575 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP2P42575 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP2P42575 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP2P42575 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP2P42575 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP2P42575 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP2P42575 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP2P42575 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP2P42575 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP2P42575 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP2P42575 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP2P42575 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP2P42575 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP2P42575 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP2P42575 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP2P42575 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP2P42575 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP2P42575 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP2P42575 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP2P42575 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP2P42575 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP2P42575 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP2P42575 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP2P42575 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms