Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINF1P36955 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINF1P36955 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms