Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERCC5P28715 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC5P28715 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC5P28715 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms